員工在合同期間的癌癥處理如下：

(1)企業(yè)職工因病或非因工傷需要停止工作醫(yī)療時，根據(jù)本人實際工作年限和在本單位工作年限，給予三至二十四個月的醫(yī)療期；

(二)不能從事原工作或者用人單位單獨安排的工作的，由勞動鑒定委員會進行勞動能力鑒定。

工作期間得癌癥是工傷嗎？

工作期間癌癥是否為工傷，取決于情況：

1、若該病與工作原因無關，則不屬于工傷；

2、如果懷疑與工作原因有關，可以向當?shù)匦l(wèi)生部門報告申請職業(yè)病鑒定的情況，即使是工傷。

法律依據(jù)：

《中華人民共和國勞動合同法》

第四十二條勞動者有下列情形之一的，用人單位不得依照本法第四十條、第四十一條的規(guī)定解除勞動合同：

（一）從事接觸職業(yè)病危害作業(yè)的勞動者未進行離崗前職業(yè)健康檢查，或者疑似職業(yè)病病人在診斷或者醫(yī)學觀察期間的；

（二）在本單位患職業(yè)病或者因工負傷并被確認喪失或者部分喪失勞動能力的；

（三）患病或者非因工負傷，在規(guī)定的醫(yī)療期內(nèi)的；

（四）女職工在孕期、產(chǎn)期、哺乳期的；

（五）在本單位連續(xù)工作滿十五年，且距法定退休年齡不足五年的；

（六）法律、行政法規(guī)規(guī)定的其他情形。