離婚時有補償款也有共同債務，補償款屬于獲得方的個人財產，而共同債務需要夫妻雙方共同承擔。一般應先以夫妻共同財產償還共同債務，若共同財產不足以清償，或財產歸各自所有的，由雙方協議清償；協議不成的，由人民法院判決。同時，補償款不應用于償還共同債務，除非獲得補償款的一方自愿。

在離婚案件中，補償款和共同債務是兩個不同性質的問題，需要分別進行處理。

關于離婚補償款。離婚補償款通常是基于法律規定或雙方約定，在離婚時一方給予另一方的經濟補償。比如，根據《民法典》規定，夫妻一方因撫育子女、照料老年人、協助另一方工作等負擔較多義務的，離婚時有權向另一方請求補償，另一方應當給予補償。具體辦法由雙方協議；協議不成的，由人民法院判決。這部分補償款是對付出較多一方的一種經濟上的彌補，屬于獲得方的個人財產，其所有權歸獲得補償款的一方。

對于共同債務。夫妻共同債務是指夫妻雙方共同簽名或者夫妻一方事后追認等共同意思表示所負的債務，以及夫妻一方在婚姻關系存續期間以個人名義為家庭日常生活需要所負的債務。共同債務需要夫妻雙方共同承擔償還責任。在處理時，一般先以夫妻共同財產來償還。例如，夫妻雙方有共同的存款、房產等，先將這些共同財產用于償還債務。

如果夫妻共同財產不足以清償共同債務，或者夫妻雙方的財產歸各自所有的情況下，雙方可以就債務的償還進行協商，達成一致的清償協議。但如果雙方無法協商一致，就需要由人民法院根據具體情況進行判決。法院會綜合考慮雙方的經濟狀況、債務的形成原因等因素，合理確定雙方分擔債務的比例。

需要強調的是，補償款與共同債務之間沒有直接的關聯，補償款不應用于償還共同債務，除非獲得補償款的一方自愿將其用于償還債務。這樣的處理方式既保障了付出較多一方獲得補償的權利，也合理分擔了夫妻共同債務，維護了雙方的合法權益。